什么是开放阅读框 非编码区与外显子、开放阅读框的关系谢谢
什么是开放阅读框
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列,可编码相应的蛋白。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可能按六种框架阅读和翻译(每条链三种,对应三种不同的起始位点)。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。
非编码区与外显子、开放阅读框的关系?谢谢
http://kczy.zjut.edu.cn/microbiology/UploadThumbs/2004522105443526.gif
整个编码区可以看做一个ORF。ORF排除了内含子就是CDS。
开放阅读框与外显子和内含子的关系是什么?
开放式阅读框ORF是指从启示密码子开始,到终止密码子结束的一段序列,其内部序列是都用来翻译的,外显子是指DNA中能用来翻译表达蛋白质的序列,也包括很多调控基因,内含子,就是染色质DNA上不用来翻译表达的序列。其实本质上说 ORF是指MRNA上的核苷酸序列,而外显子和内含子是指DNA上的脱氧核苷酸序列。
怎样快速找到基因序列的开放阅读框
可以先到NCBI的数据库去找,里面会有基因的详细信息,有一些软件分析的时候也会给出已知的基因的ORF。如果没有就要自己分析了,一般是有ATG作为起始密码子,在这个ATG前有3种终止密码子中的一个。